儀器日常基本維護：
1.每日檢查鋼瓶壓力供應是否足夠。若存量小于500psi（即3.5Mpa）就需要更換。
2. 定期更換進樣器的墊片，一般1~2周換一次，根據進樣次數酌情處理。更換密封墊時注意密封墊的類型：一般密封和高溫密封；我們使用的是高溫密封，高溫密封墊的一面有一層膜，使用時帶膜的面朝下；在密封時不宜擰得太緊，以免在高溫情況下密封墊膨脹，不利于進樣（進樣針容易折）。
3.檢查色譜柱是否發生漏氣或者斷裂。
4.開機后檢查各個實際值是否能達到設定值。
5.進樣前，要確保進樣針潔凈，以免污染進樣口乃至GC系統。
6.定期檢查氣路是否漏氣。氣路接頭和鋼瓶閥檢漏可以用肥皂水檢漏；減壓閥檢漏可以憋壓，1小時左右后觀察氣壓是否下降明顯。色譜柱檢漏主要檢測接頭襯管處是否漏。在氣路的出口放一小杯清水，將氣路出口管插入其中（液面一下1cm左右），看排出的氣泡是否均勻。
7.定期檢查進樣口、色譜柱和檢測器是否被污染。可以做個空白樣的流失圖來觀察。做流失圖的操作條件：一般從50℃以10℃/min升到240℃并保持10min。柱流量設置在2ml/min。正常情況下，應該只是基線和噪音，如果出現峰，說明系統被污染，很有可能是從進樣口帶來的污染物。如果在正常使用狀態下，色譜柱的性能開始下降，基線信號值會增加，另外，如果在很低溫度下，基線信號值明顯地大于初始值。那么很有可能是色譜柱和GC系統被污染。
8.通過進標準樣來檢測色譜柱是否需要更換。
9.新的色譜柱有良好的韌性和剛性，不易折斷，經過較長時間使用以后，特別是經過多次老化以后，色譜柱就會變脆，失去韌性，易折斷。
10.熱導檢測器的清洗方法：將丙酮、乙醚、十氫萘等溶劑裝進檢測器的測量池，浸泡一段時間后（大約20分鐘）后除去溶劑，這樣反復操作數次直至浸泡后的溶液比較干凈為止。如果選擇一種溶劑不能清洗干凈時，可根據沾污物的性質先選擇高沸點溶劑進行浸泡清洗，然后再用低沸點的溶劑反復清洗。洗凈后加熱趕除溶劑，再安裝到儀器上，加熱檢測器并通載氣數小時后即可使用。
氫火焰離子化檢測器的清洗方法：當沾污不太嚴重時，可不必清洗，此時只需要取下色譜柱，用一根管子將進樣口和檢測器相連，然后通載氣并將檢測器的溫度升到120℃以上，從進樣口先注入20ul左右的蒸餾水，再用幾十微升的丙酮或者氟利昂作溶劑進行清洗。在此溫度下保持1~2小時后檢查基線是否平穩，若不平穩可以重復以上操作或卸下來清洗。當沾污物比較嚴重時，必須卸下來清洗。先卸下收集極、正極和噴嘴等，若噴嘴是石英材質，先要將其放在水中進行浸泡過夜。若噴嘴是不銹鋼材質，則可以與電極等一起，先小心用細砂紙（300~400#）輕輕地打磨，再用適當的溶劑（可以浸泡在甲醇和苯1:1的溶劑中）清洗，也可以用超聲波清洗器清洗，最后用甲醇洗凈，放置烘箱中烘干。請勿用含有鹵素元素的溶劑清洗，以免與聚四氟乙烯材料作用，導致噪音增加。洗凈后的各個不見要用鑷子取，勿用手摸。烘干后裝配時也要小心，否則會導致再次污染。裝入儀器后先通載氣半小時以上后再升溫點火。一般最好在120℃保持數小時后再升至工作溫度。一般情況下如操作FID時遇到尖峰噪音（基線毛刺），不提倡清洗檢測器。因為清洗檢測器麻煩而且很容易噴嘴折斷，損失很大。因此我們一般先找其他原因，可以從以下幾點考慮：
分流比是否合適 / 汽化室是否被嚴重污染 / 柱流失是否嚴重（柱子老化不夠）
電流放大器不穩定 / 極化電壓不穩定 / 有關信號連接接觸不良 / 市電不穩定 / 接地是否正確有效 / 數據參數是否設置得當 / 氣體純度是否不夠（如果用氣體發生器時很容易發生這樣的事情） / 色譜柱連接以后是否有嚴重漏氣